Phyloscan
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| Phyloscan | |
|---|---|
| Desenvolvedor | Wadsworth Center, New York State Department of Health |
| Lançamento | 14 de março de 2005 |
| Versão estável | 2.2 (28 de janeiro de 2010) |
| Sistema operacional | Multiplataforma |
| Gênero(s) | Bioinformática |
| Página oficial | phyloscan |
Phyloscan é um serviço web service para análise de seqüências de ADN que é livre e aberto a todos usuários (sem necessidade de login).
Para a localização de pareamentos de seqüências motivo especificadas pelo usuário para um sítio de ligação regulatório, Phyloscan fornece uma varredura estatisticamente sensível de seqüência mistas de ADN alinhados e não alinhados fornecidas pelo usuário. A força do Phyloscan é que ele reúne
- O método Staden para computação da significância estatística,
- O "modelo de motivo de filogenética" funcionalidade de digitalização do software MONKEY este modela relacionamentos evolutivos entre seqüências alinhadas,
- O uso do método Bailey & Gribskov para combinar as estatísticas não-alinhadas em seqüência de dados, e
- A técnica Neuwald & Green para combinar estatísticas em vários sítios de ligação encontrados dentro de uma única região do gene promotor.